وأدى هذا التحديث إلى حدوث أعطال من نوعية "Error 56" في بعض أجهزة آيباد برو (9.7 بوصة)، وفقا لموقع "ذا فيرج"
 المتخصص. وأكدت أبل أنها تعمل حاليا على إصلاح هذا الخلل، الذي أثر على شريحة صغيرة من المستخدمين، بحسب وصفها في
 التعليق الذي أرسلتهالشركة إلى موقع iMore.وبالنسبة لمن استمروا في العمل بالإصدار "9.3.1" فلن يتم حثهم على الترقية قبل
 إيجاد إصلاح للعيب.